Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der Analytik und Pharmakologie von bioaktiven zyklischen Pflanzenpeptiden. Als Hauptvertreter zählen dazu die Defensine, Orbitide und Zyklotide. Diese sogenannten Zyklotide („cyclotides“ im Engl.) sind extrem stabile Moleküle aufgrund ihres zyklischen Peptidrückgrats und drei konservierten Disulfidbrücken („cyclic cystine-knot“). Unter anderem agieren Zyklotide als Enzyminhibitoren und könnten z.B. für die Entwicklung als Wirkstoffe von neurodegenerativen Krankheiten eingesetzt werden. Um eine pharmazeutische Anwendung zu gewährleisten, ist es notwendig natürlich-vorkommende Peptide aus Pflanzen zu isolieren und mittels hochauflösenden analytischen Methoden (HPLC/MS) zu sequenzieren. Daneben verwenden wir Transkriptomdaten um in silico nach neuartigen Peptiden zu suchen. Nach Aufreinigung oder Synthese wird die Aktivität der Peptide in Zell bzw. Enzym-basierten Assays erforscht.

Ziel dieser Diplomarbeit ist es die Struktur neuartiger Pflanzenpeptide (mit Fokus auf
Zyklotiden) verschiedener Pflanzenspezies mit Hilfe modernster Peptidomics Methodik zu bestimmen (Hellinger et al., J Proteome Res, 2015), im evolutiven Kontext zu analysieren (Gruber et al., Plant Cell, 2008) und pharmakologisch zu untersuchen (Hellinger et al., J Nat Prod, 2015; Koehbach et al., PNAS, 2013). Praktikumserfahrung in HPLC Analytik und Massenspektrometrie sind erwünscht aber nicht zwingend erforderlich.

Forschungsbeihilfe möglich! Interessierte und motivierte StundentInnen der Chemie, Pharmazie, Biochemie oder eines verwandten Fachgebiets senden bitte einen kurzen Lebenslauf per Email an Christian Gruber.